O Programa de Limpeza da Bacia de Acumulação da Serra do Facão Energia foi desenvolvido com o objetivo de manter a qualidade da água do reservatório, a fauna e a flora local, as condições de usos múltiplos do lago e a saúde da população.
O levantamento florístico e fitossociológico forneceu dados sobre a quantidade da biomassa que deveria ser suprimida para evitar que gases resultantes da decomposição da vegetação submersa causasse eutrofização da água, ou seja, falta de oxigênio para a vida aquática. Possibilitou também identificar remanescentes vegetais que, interligados à mata ciliar, pudessem acolher a fauna local e mapear árvores a serem doadas aos proprietários dos imóveis rurais onde elas se localizavam.
A doação de lenha e de toras aos moradores lindeiros, para utilização na propriedade rural, respeitou as autorizações emitidas pelo IBAMA e a assinatura de um termo de recebimento entre proprietários e SEFAC.
Para eliminar fontes de contaminação de água por organismos causadores de doenças, foi realizada a remoção de todas as benfeitorias nas propriedades de moradores remanejados e posterior desinfecção de fossas, currais, pocilgas e similares.
As informações sobre a circulação da fauna silvestre orientaram o planejamento da condução do desmatamento no Plano de Supressão Vegetal da Bacia de Acumulação, adequando os procedimentos de modo a facilitar o deslocamento espontâneo da fauna silvestre. A supressão foi organizada em frentes de trabalho, acompanhadas por equipes de resgate da fauna e da flora, minimizando a perda de carga genética das espécies atingidas pelo desmatamento.
Após aprovação do Plano de Supressão Vegetal e liberação das Autorizações de Supressão da Vegetação, ambas emitidas pelo IBAMA, iniciaram as atividades de demarcação topográfica e abertura de acesso aos fragmentos selecionados, roçada e derrubada da vegetação, limpeza das áreas destinadas a galharia (restos de galhos, folhas, flores, frutos), baldeio das lenhas e toras, transporte para pátios de enleiramento, além de estoque e cubagem para posterior comercialização.
Como etapa final deste programa, houve a destinação econômica do material lenhoso gerado pelas atividades de supressão vegetal, a maior parte do material foi doado aos proprietários lindeiros e comercializado com empresas da região em forma de lenha.
Para o remanescente do material que ficou estocado em pátios de armazenagem, a SEFAC implantou um projeto de pesquisa e desenvolvimento (P&D) para a seleção de rota tecnológica mais adequada ao aproveitamento energético integrado dos resíduos florestais lenhosos oriundos de desmatamento da bacia de reservatórios artificiais.
As diversas ações desenvolvidas atenderam às exigências legais, proporcionando total segurança ao enchimento do reservatório e operação da Usina Hidrelétrica Serra do Facão.